铁皮石斛的副作用很小，几乎可以忽略不计。同时石斛的的历史史树有多篇幅的文献记载，可见，石斛在远古时期就已经广泛使用。
《神农本草经》中有记载：石斛主伤中，除痹，下气，补五脏虚劳羸瘦，强阴，久服厚肠胃。”《本草纲目拾遗》有：“清胃，除虚热，生津，已劳损，以之代茶，开胃健脾。”现代研究表明，本品含多量的石斛碱、多糖等。石斛具有增强人体免疫力，消除肿瘤，抑制癌症等作用。
铁皮石斛的功效主要有：滋阴生津护养五脏、增强体质，提高免疫力、强筋健骨，抵抗风湿、补益脾胃、利胆，治肝胆疾病、防治糖尿病、抑制肿瘤，减少放、化疗副作用、名目护眼，以及补水润肤、延年益寿等。而铁皮石斛这些功效的发挥，都是以内服的方法实现的。

可见铁皮石斛的副作用不明显，毒性很低。临床认为“甘平无毒”。中毒剂量的石斛可引起惊厥，阿密妥钠可解其毒，临床曾有应用石斛致过敏性皮炎的报告。宜忌：本品能敛邪，使邪不外达，所以温热病不宜早用本品；其又能助湿，如湿温尚未化燥者忌服。本品与凝水石、巴豆相克；不宜与僵蚕、雷丸同用。